2009年，市野生动凯发k8国际首页登录-凯发k8娱乐保护管理站组织相关人员对本市水鸟较为聚集的10个湿地区域开展了16次同步调查，这10个调查区域分别为崇明东滩鸟类自然保护区管理处核心区、崇明东滩鱼蟹塘、崇明北湖、南汇东滩、奉贤边滩、九段沙自然保护区、宝钢水库、三甲港、长兴横沙边滩和淀山湖。
本次调查共记录到水鸟111种160713只次，其中留鸟为4种，夏候鸟为11种，冬候鸟为47种，旅鸟为49种；游禽为47种，涉禽为64种。共记录到白头鹤等国家级保护鸟类10种；记录到5个物种达到或超过了东亚地区水鸟种群数量估计的1%标准；记录数量最多的10种水鸟为：骨顶鸡、斑嘴鸭、黑腹滨鹬、白鹭、赤颈鸭、绿头鸭、罗纹鸭、绿翅鸭、赤膀鸭和环颈鸻，这10种鸟占到了记录总数的71.88%。
从鸟类的种类分布来看，南汇东滩野生动物禁猎区最高，为92种，其次分别是奉贤边滩、崇明东滩保护区、九段沙保护区、崇明东滩鱼蟹塘、崇明北湖、宝钢水库、三甲港。
根据调查结果显示：2009年度水鸟依然主要集中在沿海的湿地区域内活动，其中南汇东滩禁猎区、横沙东滩、崇明东滩保护区、九段沙保护区是本市记录水鸟数量最多的区域，其记录数量分别占到了记录总数的23.58%、18.48%、15.29%和14.9%%；而南汇东滩禁猎区、奉贤边滩、崇明东滩保护区和九段沙保护区记录的水鸟种类是最高，其记录鸟种数分别占到了总鸟种数的82.88%、74.77%、65.77%和57.66%。
本年度调查记录的水鸟数量与2008年、2007年、2006年相比，呈现出明显的波动。2009年记录数量分别为2006年记录数的78.19%、2007年记录数的108.14%和2008年记录数的116.74%。如果以前三年相同的调查次数相比，2009年记录的数量为2006年度的56.02%，为2007年度的102.22%，为2008年度的116.74%；从记录种类上来说，略有下降。
不同生态类群的水鸟结构开始改变。从记录来看，2006年所记录的水鸟以鸻鹬类和雁鸭为主，其余的类群数量均很少；而2007年雁鸭类所占的比例有所缩小，鸻鹬类的比例有所增加；2008年鸻鹬类比例开始相继减少，而鹤形目和鹳形目鸟类数量却有明显增加；2009年雁鸭类有所增加，但鸻鹬类却明显减少，鹤形目鸟类的数量却大幅上升。
其中雁鸭类总数量为2006年记录总数量的79.14%，为2007年记录总数量的150.66%，为2008年度的159.4%；鸻鹬类总数量为2006年记录总数的32.13%，为2007年度的39.03%，为2008年度的56.60%；鸥类总数量为2006年总量的84.33%，为2007年度总数量的107.23%，为2008年度的77%；其余各大类群的记录总数均较往年有不同程度的增加。
鸻鹬类下降最为明显，本年度南汇东滩的鸻鹬类记录数仅为2006年度的6.87%，2007年度的13.08%，2008年度的51.94%。崇明东滩保护区的鸻鹬类也呈下降趋势，分别只有2006年度的49.06%、2007年度的30.69%和2008年度的38.36%；九段沙保护区也有所下降，分别只有2006年度的42.83%、2007年度的91.88%和2008年度的68.85%。
鹤形目鸟类的明显增加，其主要原因是随着气候等因素的改变，原为冬候鸟的骨顶鸡，已有相当一部分的数量在本市南汇东滩等区域内繁殖，从而在一定程度上吸引了南迁过程中的同类在此停歇，从而造成了本市骨顶鸡的记录数量达到了历史最高水平。骨顶鸡2009年的数量分别比前三年的2213%、981%和508%。
不同居留类型的水鸟结构也正在改变。从记录来看，2006年所记录的水鸟以旅鸟和冬候鸟为主，留鸟和夏候鸟数量均很少；而2007年留鸟所占的比例明显增加；2008年旅鸟比例明显减少，而冬候鸟和夏候鸟的比例却明显上升；2009年，冬候鸟占到了绝大多数，而旅鸟的数量却降至最低。
根据分析，其主要的原因是：
2009年由于受到多股强冷空气的影响，导致大量水鸟受冷空气挤压，迁往相对较为暖和的南方越冬，这对于部分在北方越冬的雁鸭类来说更为明显，因此造成了本市雁鸭类数量有所增加；
根据近年俄罗斯和澳大利亚的相关调查证实，整个迁徙路线上的鸻鹬类数量正在减少。同时，由于近年来本市自然滩涂面积的相对减少，尤其是潮间滩面积的减少。因此，本市的鸻鹬类数量也正在逐年下降；
生态环境的改变，也是导致不同生态类群数量变化的原因之一。由于很多已围垦土地逐步的陆地化，仅余下少量的深水池塘，而堤坝外侧的自然滩涂尚未发育完善，因此造成了依赖滩涂或浅水沼泽生存的迁徙鸻鹬数量明显下降，而喜深水的雁鸭类数量则有所增加。
由于横沙东滩的一期围垦工程已经结束，目前正在进行人工吹沙以提高土地高程，从而造成已围垦区域内的水域环境多样化，且底栖生物随着泥沙一起进入，形成了丰富的食物来源，因此，今年冬季在横沙东滩吸引了大量的游禽在此觅食、越冬。